Trois ans aprés les événements du premiers Battle Royale, Shuya est devenu, un terroriste internationale. Décider a supprimer cette menace grandissante, le gouvernement envoie un classe de 42 éléves sur l’ile ou s’est réfugié la troupe de mercenaire dirigé par Shuya. Parmi eux, se trouve, Shiori Kitano, la fille de son ancien professeur...